Con reiniciar supongo que te refieres a formatear...
Bueno, pues yo para las copias de seguridad simplemente grabo lo que quiera conservar en CDs o DVDs (en mi caso regrabables) y cuando está el ordenador formateado lo paso todo de nuevo al disco duro.
Para formatear, mete el CD de Windows (si usas otro sistema operativo no sé exactamente cómo será porque no he usado otros) y reinicia el ordenador. Te saldrá que pulses alguna tecla para iniciar desde el CD o DVD, y cuando pulses se iniciará el programa de instalación, que te dará la opción de formatear el disco duro.